Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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BRD3Q15059 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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BRD3Q15059 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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BRD3Q15059 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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BRD3Q15059 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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BRD3Q15059 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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BRD3Q15059 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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BRD3Q15059 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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BRD3Q15059 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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