Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRAM2Q15035 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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