Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SLC10A1Q14973 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1854.1 ms