Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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