Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL9A3Q14050 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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