Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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