Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
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PTCH1Q13635 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
PTCH1Q13635 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTCH1Q13635 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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