Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL1Q13616 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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