Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
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