Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
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