Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
IKZF1Q13422 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms