Protein–RNA interactions for Protein: Q13371

PDCL, Phosducin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCLQ13371 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDCLQ13371 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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