Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCGQ13326 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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