Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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