Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms