Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CHAF1BQ13112 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CHAF1BQ13112 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CHAF1BQ13112 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHAF1BQ13112 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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