Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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CSTF3Q12996 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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CSTF3Q12996 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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CSTF3Q12996 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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CSTF3Q12996 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSTF3Q12996 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSTF3Q12996 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSTF3Q12996 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSTF3Q12996 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSTF3Q12996 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSTF3Q12996 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSTF3Q12996 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
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