Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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CNTN1Q12860 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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CNTN1Q12860 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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CNTN1Q12860 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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CNTN1Q12860 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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CNTN1Q12860 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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CNTN1Q12860 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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CNTN1Q12860 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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CNTN1Q12860 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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CNTN1Q12860 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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CNTN1Q12860 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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