Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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BPTFQ12830 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPTFQ12830 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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