Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RAB40BQ12829 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.8 ms