Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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