Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC15Q0P6D6 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms