Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms