Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms