Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLDN10P78369 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLDN10P78369 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLDN10P78369 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms