Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBB4BP68371 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms