Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ABCE1P61221 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms