Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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UBE2NP61088 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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UBE2NP61088 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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UBE2NP61088 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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UBE2NP61088 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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UBE2NP61088 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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UBE2NP61088 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBE2NP61088 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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