Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms