Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA9P57773 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA9P57773 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA9P57773 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA9P57773 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA9P57773 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA9P57773 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA9P57773 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA9P57773 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA9P57773 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA9P57773 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA9P57773 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA9P57773 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA9P57773 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA9P57773 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA9P57773 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA9P57773 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA9P57773 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA9P57773 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA9P57773 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA9P57773 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA9P57773 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GJA9P57773 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA9P57773 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA9P57773 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA9P57773 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA9P57773 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA9P57773 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA9P57773 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA9P57773 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA9P57773 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA9P57773 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA9P57773 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA9P57773 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA9P57773 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA9P57773 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA9P57773 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA9P57773 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA9P57773 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA9P57773 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA9P57773 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA9P57773 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA9P57773 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA9P57773 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA9P57773 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA9P57773 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA9P57773 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA9P57773 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA9P57773 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA9P57773 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA9P57773 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA9P57773 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA9P57773 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA9P57773 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA9P57773 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA9P57773 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA9P57773 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA9P57773 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA9P57773 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA9P57773 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA9P57773 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GJA9P57773 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GJA9P57773 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GJA9P57773 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GJA9P57773 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GJA9P57773 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GJA9P57773 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GJA9P57773 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GJA9P57773 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GJA9P57773 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GJA9P57773 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GJA9P57773 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GJA9P57773 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GJA9P57773 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GJA9P57773 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GJA9P57773 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GJA9P57773 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GJA9P57773 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GJA9P57773 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GJA9P57773 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GJA9P57773 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GJA9P57773 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GJA9P57773 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GJA9P57773 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GJA9P57773 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GJA9P57773 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GJA9P57773 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GJA9P57773 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GJA9P57773 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GJA9P57773 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GJA9P57773 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GJA9P57773 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GJA9P57773 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GJA9P57773 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GJA9P57773 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GJA9P57773 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GJA9P57773 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GJA9P57773 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GJA9P57773 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GJA9P57773 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms