Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME5P56597 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME5P56597 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME5P56597 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME5P56597 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME5P56597 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME5P56597 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME5P56597 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME5P56597 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME5P56597 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME5P56597 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME5P56597 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NME5P56597 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME5P56597 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NME5P56597 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME5P56597 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME5P56597 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME5P56597 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME5P56597 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME5P56597 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME5P56597 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME5P56597 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME5P56597 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME5P56597 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME5P56597 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME5P56597 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME5P56597 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME5P56597 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME5P56597 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME5P56597 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME5P56597 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME5P56597 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME5P56597 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME5P56597 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME5P56597 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME5P56597 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME5P56597 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME5P56597 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME5P56597 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME5P56597 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME5P56597 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME5P56597 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NME5P56597 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME5P56597 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME5P56597 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NME5P56597 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME5P56597 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NME5P56597 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME5P56597 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME5P56597 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME5P56597 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NME5P56597 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME5P56597 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME5P56597 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME5P56597 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME5P56597 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NME5P56597 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME5P56597 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME5P56597 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NME5P56597 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME5P56597 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME5P56597 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME5P56597 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME5P56597 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME5P56597 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME5P56597 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME5P56597 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME5P56597 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME5P56597 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME5P56597 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME5P56597 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME5P56597 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME5P56597 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME5P56597 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME5P56597 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME5P56597 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME5P56597 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME5P56597 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME5P56597 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME5P56597 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME5P56597 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME5P56597 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME5P56597 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME5P56597 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME5P56597 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME5P56597 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME5P56597 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NME5P56597 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME5P56597 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME5P56597 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME5P56597 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME5P56597 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME5P56597 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME5P56597 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME5P56597 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME5P56597 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME5P56597 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME5P56597 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME5P56597 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME5P56597 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms