Protein–RNA interactions for Protein: P52747

ZNF143, Zinc finger protein 143, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF143P52747 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF143P52747 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF143P52747 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms