Protein–RNA interactions for Protein: P52738

ZNF140, Zinc finger protein 140, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF140P52738 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF140P52738 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF140P52738 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms