Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GTF2A1P52655 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms