Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTAP49354 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTAP49354 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTAP49354 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTAP49354 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTAP49354 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTAP49354 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTAP49354 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTAP49354 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTAP49354 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTAP49354 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTAP49354 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTAP49354 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTAP49354 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTAP49354 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTAP49354 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTAP49354 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTAP49354 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTAP49354 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTAP49354 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTAP49354 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTAP49354 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTAP49354 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTAP49354 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTAP49354 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTAP49354 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTAP49354 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTAP49354 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTAP49354 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTAP49354 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTAP49354 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTAP49354 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTAP49354 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTAP49354 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTAP49354 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTAP49354 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTAP49354 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTAP49354 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTAP49354 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTAP49354 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTAP49354 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTAP49354 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTAP49354 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTAP49354 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTAP49354 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTAP49354 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTAP49354 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTAP49354 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTAP49354 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTAP49354 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTAP49354 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTAP49354 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTAP49354 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTAP49354 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTAP49354 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTAP49354 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTAP49354 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTAP49354 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTAP49354 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTAP49354 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTAP49354 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTAP49354 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTAP49354 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTAP49354 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTAP49354 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTAP49354 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTAP49354 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTAP49354 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTAP49354 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTAP49354 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTAP49354 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTAP49354 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTAP49354 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTAP49354 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTAP49354 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTAP49354 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTAP49354 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTAP49354 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTAP49354 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTAP49354 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTAP49354 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTAP49354 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTAP49354 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTAP49354 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTAP49354 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FNTAP49354 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTAP49354 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTAP49354 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTAP49354 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTAP49354 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTAP49354 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTAP49354 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTAP49354 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTAP49354 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTAP49354 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTAP49354 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTAP49354 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTAP49354 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTAP49354 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTAP49354 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms