Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMAN1P49257 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMAN1P49257 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMAN1P49257 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMAN1P49257 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMAN1P49257 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMAN1P49257 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMAN1P49257 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMAN1P49257 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMAN1P49257 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMAN1P49257 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMAN1P49257 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMAN1P49257 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMAN1P49257 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMAN1P49257 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMAN1P49257 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMAN1P49257 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LMAN1P49257 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMAN1P49257 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMAN1P49257 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMAN1P49257 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMAN1P49257 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMAN1P49257 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMAN1P49257 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMAN1P49257 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMAN1P49257 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMAN1P49257 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMAN1P49257 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMAN1P49257 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMAN1P49257 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMAN1P49257 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMAN1P49257 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMAN1P49257 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LMAN1P49257 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMAN1P49257 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms