Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
CHRNA4P43681 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CHRNA4P43681 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CHRNA4P43681 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
CHRNA4P43681 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
CHRNA4P43681 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
CHRNA4P43681 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
CHRNA4P43681 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CHRNA4P43681 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CHRNA4P43681 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms