Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPD2P43304 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GPD2P43304 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPD2P43304 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPD2P43304 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GPD2P43304 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GPD2P43304 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPD2P43304 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPD2P43304 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPD2P43304 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPD2P43304 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPD2P43304 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPD2P43304 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPD2P43304 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPD2P43304 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPD2P43304 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPD2P43304 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPD2P43304 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPD2P43304 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPD2P43304 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPD2P43304 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPD2P43304 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPD2P43304 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPD2P43304 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPD2P43304 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPD2P43304 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPD2P43304 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPD2P43304 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPD2P43304 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPD2P43304 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPD2P43304 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPD2P43304 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPD2P43304 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GPD2P43304 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPD2P43304 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPD2P43304 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPD2P43304 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPD2P43304 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPD2P43304 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPD2P43304 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPD2P43304 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPD2P43304 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GPD2P43304 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPD2P43304 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPD2P43304 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GPD2P43304 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GPD2P43304 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GPD2P43304 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPD2P43304 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPD2P43304 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPD2P43304 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GPD2P43304 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPD2P43304 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPD2P43304 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPD2P43304 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPD2P43304 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPD2P43304 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPD2P43304 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPD2P43304 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPD2P43304 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPD2P43304 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPD2P43304 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPD2P43304 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPD2P43304 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPD2P43304 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPD2P43304 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPD2P43304 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPD2P43304 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPD2P43304 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPD2P43304 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPD2P43304 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPD2P43304 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPD2P43304 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GPD2P43304 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GPD2P43304 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPD2P43304 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPD2P43304 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPD2P43304 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GPD2P43304 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPD2P43304 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPD2P43304 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPD2P43304 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GPD2P43304 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPD2P43304 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPD2P43304 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPD2P43304 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPD2P43304 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPD2P43304 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GPD2P43304 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GPD2P43304 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GPD2P43304 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GPD2P43304 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GPD2P43304 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GPD2P43304 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GPD2P43304 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GPD2P43304 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GPD2P43304 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GPD2P43304 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GPD2P43304 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPD2P43304 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms