Protein–RNA interactions for Protein: P40879

SLC26A3, Chloride anion exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A3P40879 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC26A3P40879 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms