Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PBX2P40425 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PBX2P40425 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PBX2P40425 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PBX2P40425 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PBX2P40425 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PBX2P40425 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PBX2P40425 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PBX2P40425 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PBX2P40425 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PBX2P40425 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PBX2P40425 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PBX2P40425 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PBX2P40425 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PBX2P40425 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PBX2P40425 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PBX2P40425 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PBX2P40425 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PBX2P40425 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PBX2P40425 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PBX2P40425 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PBX2P40425 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PBX2P40425 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PBX2P40425 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PBX2P40425 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PBX2P40425 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PBX2P40425 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PBX2P40425 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PBX2P40425 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PBX2P40425 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PBX2P40425 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PBX2P40425 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PBX2P40425 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PBX2P40425 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PBX2P40425 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PBX2P40425 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PBX2P40425 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PBX2P40425 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PBX2P40425 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PBX2P40425 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PBX2P40425 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PBX2P40425 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PBX2P40425 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PBX2P40425 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PBX2P40425 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PBX2P40425 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PBX2P40425 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PBX2P40425 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PBX2P40425 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PBX2P40425 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PBX2P40425 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PBX2P40425 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PBX2P40425 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PBX2P40425 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PBX2P40425 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PBX2P40425 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PBX2P40425 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PBX2P40425 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PBX2P40425 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PBX2P40425 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PBX2P40425 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PBX2P40425 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PBX2P40425 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PBX2P40425 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PBX2P40425 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PBX2P40425 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PBX2P40425 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PBX2P40425 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PBX2P40425 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PBX2P40425 ETFRF1-207ENST00000556351 838 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PBX2P40425 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PBX2P40425 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PBX2P40425 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PBX2P40425 AC005954.1-201ENST00000591962 337 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PBX2P40425 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PBX2P40425 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PBX2P40425 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PBX2P40425 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PBX2P40425 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PBX2P40425 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PBX2P40425 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PBX2P40425 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PBX2P40425 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PBX2P40425 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PBX2P40425 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PBX2P40425 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PBX2P40425 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PBX2P40425 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PBX2P40425 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PBX2P40425 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PBX2P40425 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PBX2P40425 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PBX2P40425 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PBX2P40425 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PBX2P40425 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PBX2P40425 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PBX2P40425 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PBX2P40425 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PBX2P40425 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PBX2P40425 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms