Protein–RNA interactions for Protein: P40305

IFI27, Interferon alpha-inducible protein 27, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI27P40305 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
IFI27P40305 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
IFI27P40305 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
IFI27P40305 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
IFI27P40305 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
IFI27P40305 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
IFI27P40305 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
IFI27P40305 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
IFI27P40305 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
IFI27P40305 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
IFI27P40305 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
IFI27P40305 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
IFI27P40305 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
IFI27P40305 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
IFI27P40305 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
IFI27P40305 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
IFI27P40305 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
IFI27P40305 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
IFI27P40305 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
IFI27P40305 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
IFI27P40305 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
IFI27P40305 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
IFI27P40305 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
IFI27P40305 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
IFI27P40305 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
IFI27P40305 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
IFI27P40305 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
IFI27P40305 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
IFI27P40305 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
IFI27P40305 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
IFI27P40305 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
IFI27P40305 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
IFI27P40305 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
IFI27P40305 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms