Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGAEP38570 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGAEP38570 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms