Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms