Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms