Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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HOXD13P35453 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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HOXD13P35453 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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HOXD13P35453 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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HOXD13P35453 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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HOXD13P35453 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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