Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD12P35452 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms