Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TM4SF1P30408 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms