Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5DP30049 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122 ms