Protein–RNA interactions for Protein: P29508

SERPINB3, Serpin B3, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB3P29508 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SERPINB3P29508 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms