Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms